Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-5Q9HDB9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ERVK-5Q9HDB9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms