Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDGFDQ9GZP0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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