Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2J2Q9GZM3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms