Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRCC1Q9C099 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms