Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRNKL1Q9BZJ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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