Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms