Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CARD11Q9BXL7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CARD11Q9BXL7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms