Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SALL3Q9BXA9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SALL3Q9BXA9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms