Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCP2Q9BX26 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms