Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
HIGD2AQ9BW72 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms