Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf16Q9BUW7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms