Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PI4K2AQ9BTU6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms