Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2AFJQ9BTM1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms