Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYT11Q9BT88 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms