Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms