Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBA1CQ9BQE3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms