Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIN3AQ96ST3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIN3AQ96ST3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms