Protein–RNA interactions for Protein: Q96SA4

SERINC2, Serine incorporator 2, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC2Q96SA4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SERINC2Q96SA4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SERINC2Q96SA4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms