Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC85AQ96PX6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms