Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ARAP1Q96P48 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms