Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SAMD8Q96LT4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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