Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
UBE2E2Q96LR5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
UBE2E2Q96LR5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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