Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EP400Q96L91 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EP400Q96L91 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms