Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCARF2Q96GP6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms