Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC97Q96F63 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms