Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNFT2Q96EX2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNFT2Q96EX2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms