Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms