Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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RABGGTAQ92696 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RABGGTAQ92696 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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