Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPDL3BQ92485 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms