Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SPTSSBQ8NFR3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms