Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C17orf47Q8NEP4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms