Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF548Q8NEK5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF548Q8NEK5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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