Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NGDNQ8NEJ9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NGDNQ8NEJ9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms