Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ZIC4Q8N9L1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms