Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVOPQ8N4V2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVOPQ8N4V2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms