Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC117Q8IWD4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms