Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NME9Q86XW9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NME9Q86XW9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms