Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATG4DQ86TL0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms