Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HECW1Q76N89 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HECW1Q76N89 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms