Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP43Q70EL4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP43Q70EL4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP43Q70EL4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP43Q70EL4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP43Q70EL4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP43Q70EL4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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