Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms