Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF549Q6P9A3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms