Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RWDD4Q6NW29 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RWDD4Q6NW29 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms