Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM208BQ5VWN6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms