Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TCTE1Q5JU00 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms