Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
ANKRD39Q53RE8 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ANKRD39Q53RE8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms