Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GPAT3Q53EU6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms