Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

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Length 65 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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KRTAP20-2Q3LI61 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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KRTAP20-2Q3LI61 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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KRTAP20-2Q3LI61 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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KRTAP20-2Q3LI61 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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KRTAP20-2Q3LI61 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP20-2Q3LI61 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms