Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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KRTAP21-3Q3LHN1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KRTAP21-3Q3LHN1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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