Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MSMPQ1L6U9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MSMPQ1L6U9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMPQ1L6U9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMPQ1L6U9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMPQ1L6U9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MSMPQ1L6U9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms